More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_37603 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_37603  predicted protein  100 
 
 
398 aa  804    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50804  glycolate oxidase  47.73 
 
 
431 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2117  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  43.56 
 
 
381 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  36.67 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.6 
 
 
403 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1846  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.84 
 
 
382 aa  260  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.42 
 
 
409 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.3 
 
 
382 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2488  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.57 
 
 
385 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0763521  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0085  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.66 
 
 
382 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  38.01 
 
 
414 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.8 
 
 
381 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  242  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0068  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.34 
 
 
382 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368436  normal  0.0189918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.84 
 
 
417 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.65 
 
 
417 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5250  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.37 
 
 
381 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3333  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.37 
 
 
381 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0889608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5034  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.37 
 
 
381 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
422 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.86 
 
 
409 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.17 
 
 
458 aa  232  9e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.02 
 
 
427 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  36.53 
 
 
418 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.74 
 
 
410 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.39 
 
 
410 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.95 
 
 
397 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  36.22 
 
 
381 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.49 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  36.22 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  39.04 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.85 
 
 
385 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.77 
 
 
411 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  36.46 
 
 
412 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.62 
 
 
391 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  36.43 
 
 
440 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  36.79 
 
 
412 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  36.79 
 
 
412 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  36.79 
 
 
412 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  36.43 
 
 
440 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  36.43 
 
 
440 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  36.76 
 
 
383 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.05 
 
 
405 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.19 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.86 
 
 
381 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.88 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.96 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.3 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.68 
 
 
380 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  35.98 
 
 
380 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.22 
 
 
381 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  33.07 
 
 
399 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.6 
 
 
357 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.05 
 
 
386 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.77 
 
 
402 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.96 
 
 
366 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  34.22 
 
 
390 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.25 
 
 
402 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.85 
 
 
394 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.25 
 
 
379 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
381 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  35.22 
 
 
390 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
381 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
381 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.24 
 
 
380 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  34.58 
 
 
379 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
386 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  36.27 
 
 
396 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.87 
 
 
381 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.59 
 
 
378 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
379 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.4 
 
 
387 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 
379 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.46 
 
 
440 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  34.93 
 
 
396 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4670  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.29 
 
 
418 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 
379 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1831  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.51 
 
 
390 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0453167  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0829  lactate dehydrogenase  34.67 
 
 
387 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.967282  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
396 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2487  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.67 
 
 
387 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0268147  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.66 
 
 
415 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.89 
 
 
391 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.07 
 
 
403 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  33.69 
 
 
386 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  36 
 
 
395 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.24 
 
 
385 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>