More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36339 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36339  Plastid ribosomal protein S1, imported to chloroplast, small ribosomal subunit  100 
 
 
339 aa  692    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  46.82 
 
 
321 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  47.78 
 
 
390 aa  298  8e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  49.32 
 
 
331 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  49.32 
 
 
331 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.51 
 
 
341 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  46.86 
 
 
328 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  46.51 
 
 
343 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  49.32 
 
 
367 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0694  30S ribosomal protein S1  46.91 
 
 
307 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000685189  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1689  30S ribosomal protein S1  48.66 
 
 
369 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04021  30S ribosomal protein S1  48.66 
 
 
369 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03471  30S ribosomal protein S1  48.66 
 
 
371 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  49.15 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0318  30S ribosomal protein S1  47.78 
 
 
366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.721162  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03371  30S ribosomal protein S1  47.78 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03361  30S ribosomal protein S1  47.78 
 
 
363 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  47.99 
 
 
367 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03451  30S ribosomal protein S1  48.6 
 
 
363 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10847  predicted protein  43.8 
 
 
284 aa  228  8e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2502  SSU ribosomal protein S1P  37.72 
 
 
304 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230802  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3732  SSU ribosomal protein S1P  39.53 
 
 
302 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000110633  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2933  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.3 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1211  RNA binding S1 domain protein  38.08 
 
 
284 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0419  RNA binding S1 domain protein  37.89 
 
 
302 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0430  RNA binding S1 domain protein  37.89 
 
 
302 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.930952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3643  RNA binding S1 domain protein  35.84 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0726  SSU ribosomal protein S1P  38.22 
 
 
424 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1591  RNA binding S1  34.97 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.762694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1637  RNA binding S1  35.79 
 
 
412 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07751  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  35 
 
 
481 aa  175  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05331  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  33.1 
 
 
416 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.422935  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05561  30S ribosomal protein S1-like protein B, putative Nbp1  34.38 
 
 
401 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.748166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  34.77 
 
 
401 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.974619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0530  SSU ribosomal protein S1P  34.11 
 
 
404 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05941  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  33.99 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1861  SSU ribosomal protein S1P  31.46 
 
 
431 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0931144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05861  30S ribosomal protein S1 protein B, putative Nbp1  31.46 
 
 
465 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  35 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.64 
 
 
393 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.54 
 
 
403 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  35 
 
 
411 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 
382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 
382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  36.03 
 
 
382 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  35.92 
 
 
382 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  34.31 
 
 
397 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  35.1 
 
 
382 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  31.8 
 
 
427 aa  143  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  34.5 
 
 
400 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  29.86 
 
 
492 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.07 
 
 
397 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  32.37 
 
 
686 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  35.18 
 
 
736 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  30.36 
 
 
487 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  36.21 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  29.66 
 
 
490 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  28.62 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  30 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  30.32 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  30.32 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  30.32 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  37.4 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  30 
 
 
481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  30.29 
 
 
487 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  30.15 
 
 
480 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 
557 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  30.42 
 
 
495 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  29.77 
 
 
496 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  30.04 
 
 
500 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  29.29 
 
 
481 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  29.77 
 
 
485 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  29.29 
 
 
485 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  33.46 
 
 
678 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  30.04 
 
 
495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  29.28 
 
 
488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  31.01 
 
 
493 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  29.6 
 
 
492 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  34.39 
 
 
387 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  29.84 
 
 
490 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  29.93 
 
 
493 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  31.88 
 
 
705 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  30.04 
 
 
491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  29.93 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  30.04 
 
 
491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  29.28 
 
 
496 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  29.47 
 
 
499 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  29.28 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  35.58 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  28.33 
 
 
515 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  29.66 
 
 
488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  35.34 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  32.94 
 
 
387 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.73 
 
 
654 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>