More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29755 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41670  predicted protein  100 
 
 
578 aa  1184    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0326595 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29755  predicted protein  100 
 
 
578 aa  1184    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.194035  decreased coverage  0.00158169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  31.39 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  31.06 
 
 
158 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.28 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
225 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  32.58 
 
 
705 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
619 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
874 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  33.59 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1857 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
697 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
123 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1839 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38278  predicted protein  32.06 
 
 
145 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
474 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  34.45 
 
 
455 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  34.68 
 
 
119 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  29.65 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
745 aa  64.7  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1843 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
355 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 
137 aa  64.3  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
647 aa  63.9  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4108  diguanylate cyclase  30.88 
 
 
320 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  31.88 
 
 
574 aa  63.9  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  25.71 
 
 
380 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
2099 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
351 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
860 aa  63.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  25.35 
 
 
380 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1184 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 
148 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1853 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0052  response regulator protein  29.66 
 
 
299 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  25.71 
 
 
358 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1287 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25.71 
 
 
380 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
1180 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  30.89 
 
 
132 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  32.56 
 
 
123 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  34.82 
 
 
121 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  31.06 
 
 
705 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30 
 
 
443 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
984 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
827 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  36.07 
 
 
544 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 
216 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 
305 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.35 
 
 
380 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  32.82 
 
 
457 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  28.15 
 
 
139 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 
216 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  31.06 
 
 
231 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
970 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
124 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  34.75 
 
 
124 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  33.1 
 
 
733 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
1005 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1223 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.19 
 
 
835 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  25.71 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  24.65 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  32.28 
 
 
121 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  24.65 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1847 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
462 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1792 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25 
 
 
380 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
406 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
2099 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  30 
 
 
414 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
1267 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.59 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
876 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0071  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 
139 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
757 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
121 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  30.4 
 
 
124 aa  61.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
121 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  25 
 
 
380 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
131 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
1159 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.87 
 
 
130 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  32 
 
 
847 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1028  response regulator receiver protein  31.88 
 
 
141 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24862  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3787  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.15 
 
 
344 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.919533  normal  0.90313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.95 
 
 
900 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  26.72 
 
 
130 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0130  response regulator  32.54 
 
 
123 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 
882 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 
131 aa  60.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0587  response regulator receiver  31.5 
 
 
126 aa  60.8  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1160 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  36.92 
 
 
456 aa  60.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
810 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>