More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29639 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27272  ABC(ATP-binding) family transporter  100 
 
 
555 aa  1126    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29639  ABC(ATP-binding) family transporter  100 
 
 
684 aa  1386    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  27.68 
 
 
614 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  27.68 
 
 
614 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  25.7 
 
 
587 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.7 
 
 
587 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  28.95 
 
 
704 aa  142  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  26.25 
 
 
614 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  29.86 
 
 
660 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  28.05 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  27.07 
 
 
636 aa  130  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  28.35 
 
 
704 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  28.35 
 
 
712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  27.19 
 
 
621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  28.93 
 
 
591 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  28.25 
 
 
599 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  27.22 
 
 
595 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  28 
 
 
595 aa  125  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  25.74 
 
 
642 aa  125  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  27.63 
 
 
615 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  27.71 
 
 
674 aa  124  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  27.73 
 
 
626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.36 
 
 
651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.27 
 
 
588 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  28.8 
 
 
712 aa  122  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  28.99 
 
 
666 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  26.91 
 
 
602 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  30.11 
 
 
639 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  26.08 
 
 
713 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  26.88 
 
 
592 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.45 
 
 
605 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  28.03 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  25.82 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 
584 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
588 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  29.4 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  28.27 
 
 
606 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  29.54 
 
 
596 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  27.05 
 
 
708 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  27.45 
 
 
563 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  27.97 
 
 
596 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  28.89 
 
 
630 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  25.81 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  25.81 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  25.13 
 
 
583 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  27.84 
 
 
575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  25.56 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  28.92 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  23.78 
 
 
534 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  27.51 
 
 
667 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  23.18 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.63 
 
 
589 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  26.46 
 
 
608 aa  111  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  25.13 
 
 
589 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  25.32 
 
 
588 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  27.07 
 
 
586 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  27.48 
 
 
669 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  26.36 
 
 
636 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  25.24 
 
 
668 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  27.53 
 
 
583 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  26.36 
 
 
634 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  26.36 
 
 
636 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  23.18 
 
 
567 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  26.02 
 
 
606 aa  108  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  27.5 
 
 
577 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  27.4 
 
 
626 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  24.62 
 
 
589 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  32.83 
 
 
632 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  30.85 
 
 
570 aa  107  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  25.49 
 
 
662 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  24.62 
 
 
589 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  24.95 
 
 
660 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  32.13 
 
 
701 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  25.21 
 
 
662 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  31.52 
 
 
640 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  26.2 
 
 
614 aa  104  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.07 
 
 
598 aa  104  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  27.34 
 
 
660 aa  104  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  26.59 
 
 
575 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  27.02 
 
 
658 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  34.41 
 
 
662 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  27.08 
 
 
660 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  25.88 
 
 
577 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  26.52 
 
 
603 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  26.58 
 
 
637 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5526  ABC transporter domain protein  29.76 
 
 
587 aa  100  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  26.22 
 
 
660 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  27.17 
 
 
603 aa  99.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  34.04 
 
 
588 aa  99.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  33.33 
 
 
633 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  25.13 
 
 
610 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  28.13 
 
 
588 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  26.88 
 
 
667 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  25.5 
 
 
613 aa  96.3  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  21.77 
 
 
663 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  21.77 
 
 
663 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>