More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28023 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009370  OSTLU_28023  predicted protein  100 
 
 		 321 aa  651    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.66 
 
 		 368 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.19 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0624  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.8 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  33.76 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  31.45 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2837  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.73 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0449259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.94 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2102  pseudouridine synthase, RluD  32.7 
 
 		 405 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  31.39 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  31.73 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  31.55 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.07 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  30.41 
 
 		 346 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  30.41 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4400  pseudouridine synthase  27.84 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0164  RluA family pseudouridine synthase  35.06 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  30.87 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.27 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.23 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.09 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0315  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.38 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.458148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.23 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  31.73 
 
 		 224 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0790  RluA family pseudouridine synthase  30.77 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.143813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.34 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4412  pseudouridine synthase  35.68 
 
 		 228 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.91 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1312  RluA family pseudouridine synthase  30.31 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0315  pseudouridine synthase  29.1 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1390  pseudouridine synthase  29.21 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1711  RluA family pseudouridine synthase  26.95 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2767  RluA family pseudouridine synthase  31.68 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2656  pseudouridine synthase, RluA family  26.95 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000122586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1708  RluA family pseudouridine synthase  26.95 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000190104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.89 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  26.65 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.89 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0864  pseudouridine synthase  33.04 
 
 		 224 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0335511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0090  pseudouridine synthase, RluA family  29.81 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.768556 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.62 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1574  RluA family pseudouridine synthase  26.62 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.56 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  28.71 
 
 		 469 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1751  RluA family pseudouridine synthase  27.21 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000123206  normal  0.30128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0213  pseudouridine synthase  33.61 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0138576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1654  pseudouridine synthase  29.75 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142786 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0556  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.51 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  28.71 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2301  pseudouridine synthase, RluD  27.36 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08910  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  35.71 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.267328  normal  0.027473 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0397  pseudouridine synthase, RluA family  28.57 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  32.02 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  28.08 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2844  pseudouridine synthase  34.47 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0390  RluA family pseudouridine synthase  28.16 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2869  tRNA pseudouridine synthase C  31.65 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0311  pseudouridine synthase  27.85 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2949  pseudouridine synthase  34.04 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316024  hitchhiker  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3409  pseudouridine synthase  34.85 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.386946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2722  pseudouridine synthase  33.62 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1533  pseudouridine synthase  29.08 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  33.04 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0401  pseudouridine synthase  29.19 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  29.87 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0480  RluA family pseudouridine synthase  28.27 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.632369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  30.67 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22770  pseudouridine synthase, RluA family  28.66 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2033  RluA family pseudouridine synthase  27.46 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.904373  normal  0.0708013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2308  pseudouridine synthase, RluA family  28.31 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  25.41 
 
 		 551 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2633  lysozyme  27.03 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  26.47 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  30.26 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1491  pseudouridine synthase, RluA family protein  26.35 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2804  pseudouridylate synthase  27.24 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.257511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  28.86 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  25.82 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.92 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  31.15 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0208  pseudouridine synthase  32.72 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  30.09 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  26.93 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  31.91 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  27.67 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  27.67 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0361  pseudouridine synthase  32.83 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.61 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3776  pseudouridine synthase  27.43 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  25.08 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  26.11 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4712  pseudouridine synthase  26.64 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  27.01 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  27.94 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2765  pseudouridine synthase  32.31 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.416224  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  27.76 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0516  pseudouridine synthase  29.89 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  28.85 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.33 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>