More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25997 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06089  Heat shock protein 60 Precursor (60 kDa chaperonin)(Protein Cpn60) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B041]  61 
 
 
588 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.157793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
542 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
542 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.6 
 
 
544 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25997  chaperonin 60, mitochondrial  100 
 
 
584 aa  1167    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  61.52 
 
 
547 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  62.4 
 
 
545 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  60.6 
 
 
551 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  64.57 
 
 
546 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
546 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2457  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
545 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24820  mitochondria-targeted chaperonin  65.67 
 
 
579 aa  706    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  62.98 
 
 
546 aa  657    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7830  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
549 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  63.09 
 
 
547 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  64.42 
 
 
545 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  62.14 
 
 
542 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
545 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
548 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
549 aa  663    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1738  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
548 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  decreased coverage  0.00152275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  62.59 
 
 
547 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90190  predicted protein  59.41 
 
 
569 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.419732  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  61.24 
 
 
548 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  64.69 
 
 
540 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.64 
 
 
546 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  62.03 
 
 
543 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  60.88 
 
 
548 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
545 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
546 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  63.84 
 
 
543 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
548 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1044  chaperonin GroEL  59.12 
 
 
544 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
547 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  61.12 
 
 
551 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  60.6 
 
 
550 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5830  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
547 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  62.34 
 
 
547 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
546 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
546 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  62.79 
 
 
542 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
551 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0515  chaperonin GroEL  62.66 
 
 
547 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0470  chaperonin GroEL  62.85 
 
 
547 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
540 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0795  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
547 aa  661    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  62.98 
 
 
542 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
550 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  62.59 
 
 
547 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
546 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
547 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3026  chaperonin GroEL  64.19 
 
 
546 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  64.03 
 
 
546 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  62.98 
 
 
546 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.83 
 
 
547 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  63.09 
 
 
547 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
539 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  62.22 
 
 
545 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
547 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
548 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  64.95 
 
 
544 aa  680    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
542 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
549 aa  663    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0177  chaperonin GroEL  64.57 
 
 
546 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00120697  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4130  chaperonin GroEL  58.2 
 
 
544 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  61.57 
 
 
540 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  62.79 
 
 
551 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
544 aa  651    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.6 
 
 
549 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  63.17 
 
 
548 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
547 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  64.42 
 
 
545 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  62.22 
 
 
545 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
550 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6096  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
540 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
552 aa  633  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
547 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
552 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  61.5 
 
 
540 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1420  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
549 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3427  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
540 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
545 aa  630  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
546 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  58.22 
 
 
541 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
549 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  59.81 
 
 
540 aa  628  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3081  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
540 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
546 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  59.54 
 
 
548 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  60.68 
 
 
548 aa  621  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
546 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03918  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
546 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
548 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
547 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
547 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  59.35 
 
 
554 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0483  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
549 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  59.32 
 
 
552 aa  621  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  59.13 
 
 
542 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
547 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>