41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25387 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_25387  predicted protein  100 
 
 		 403 aa  809    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000120212  hitchhiker  0.00607108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  29.41 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  28.19 
 
 		 811 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 222 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.63 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 225 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.34 
 
 		 503 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 858 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  34.88 
 
 		 222 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 271 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  29.07 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 160 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.69 
 
 		 242 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  37.31 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.83 
 
 		 220 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 234 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 1056 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 		 225 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 		 210 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 		 425 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 		 210 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 		 210 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  38.33 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 161 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  35.16 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 637 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>