More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16969 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_16969  predicted protein  100 
 
 
371 aa  769    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  29.13 
 
 
250 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  25.47 
 
 
251 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  27.88 
 
 
253 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  30.56 
 
 
273 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  30.84 
 
 
250 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  30.84 
 
 
250 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1659  exonuclease III  30.43 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  33.9 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  29.18 
 
 
250 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  30.97 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1528  exonuclease III  26.91 
 
 
272 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  26.85 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  30.13 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  26.85 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  25 
 
 
255 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  26.85 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  27.1 
 
 
252 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  32.57 
 
 
249 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  31 
 
 
252 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0841  exonuclease III  27.92 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  33.16 
 
 
247 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  29.69 
 
 
252 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  29.26 
 
 
252 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  31.07 
 
 
248 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1563  exodeoxyribonuclease  27.04 
 
 
275 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  24.29 
 
 
255 aa  87  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  30.86 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  30.86 
 
 
249 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  23.77 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  30.36 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  30.85 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  25.16 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  32.58 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  29.97 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.88161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.45 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0034  exonuclease III  26.75 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  27.08 
 
 
262 aa  84  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  28.07 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  32.02 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1090  exodeoxyribonuclease III Xth  27.59 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  26.93 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1508  3'-exo-deoxyribonuclease  27.92 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000904963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  33.17 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  30.43 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  29.41 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  31.25 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.44 
 
 
237 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5639  predicted protein  28.01 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149213  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  24.66 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  26.46 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  28.63 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.58 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  29.03 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  27.18 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  29.81 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  23.89 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  27.78 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  29.5 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  27.34 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  25.93 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  25.93 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  26.92 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  27.93 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  31.49 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  31.49 
 
 
253 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  30.68 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  24.77 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  31.21 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  29.07 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  29.07 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  23.47 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  27.87 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  30.98 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  26.98 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  24.66 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  24.51 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  25.33 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  25.71 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1739  exodeoxyribonuclease III Xth  26.97 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  23.74 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  27.53 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  23.15 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  26.76 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  25.23 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  26.24 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  26.01 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  29.09 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  26.06 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1609  exodeoxyribonuclease III Xth  29.79 
 
 
264 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.456361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  27.11 
 
 
258 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  26.24 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  28.85 
 
 
257 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  28.85 
 
 
257 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  28.85 
 
 
257 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  28.85 
 
 
257 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  25.91 
 
 
270 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  27.14 
 
 
259 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  28.39 
 
 
237 aa  62.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  27.11 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>