More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16779 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_16779  predicted protein  100 
 
 		 218 aa  457  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0984073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.57 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000100067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3139  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.57 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0783  pseudouridylate synthase  39.11 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202814  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0738  pseudouridine synthase  36.57 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0821  pseudouridylate synthase  39.88 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0454843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.02 
 
 		 368 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0799  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.35 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.32 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0834  pseudouridylate synthase  38.29 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0917  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2706  pseudouridine synthase  37.79 
 
 		 217 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3706  pseudouridine synthase  38.29 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  36.42 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0733  pseudouridine synthase  38.29 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3583  pseudouridine synthase  38.29 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3515  pseudouridine synthase  38.29 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.18243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  39.13 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  34.25 
 
 		 327 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0607  pseudouridine synthase  39.61 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3557  pseudouridine synthase, RluA family  39.46 
 
 		 297 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  37.02 
 
 		 330 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  34.43 
 
 		 306 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.07 
 
 		 298 aa  94.7  9e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3630  pseudouridine synthase  40 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.146108  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  35.29 
 
 		 526 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.42 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  36.46 
 
 		 329 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0066  pseudouridine synthase  34.68 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.22289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2133  RluA family pseudouridine synthase  36.56 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03700  pseudouridylate synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32), dual specificity  38.38 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  36.31 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0175  RluA family pseudouridine synthase  34.43 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.408906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  37.16 
 
 		 623 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.99 
 
 		 300 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  39.49 
 
 		 350 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  36.13 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3623  pseudouridine synthase, RluA family  38.78 
 
 		 297 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  37.35 
 
 		 446 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0605  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000834833  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.8 
 
 		 329 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.8 
 
 		 329 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  32.99 
 
 		 302 aa  92  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  39.56 
 
 		 302 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4767  RluA family pseudouridine synthase  38.18 
 
 		 364 aa  92  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305838  hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  33.33 
 
 		 295 aa  92  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  35.09 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 		 468 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.68 
 
 		 300 aa  92  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.7 
 
 		 326 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 		 468 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  31.87 
 
 		 304 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  32.24 
 
 		 324 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3827  pseudouridine synthase  39.61 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  35.52 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1047  pseudouridine synthase  38.69 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.703498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4154  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.91 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.7 
 
 		 326 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.75 
 
 		 320 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0336491  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  40.11 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.09 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1390  pseudouridine synthase  32.2 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0480  RluA family pseudouridine synthase  33.7 
 
 		 364 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.632369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1610  pseudouridine synthase  35.06 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911925  normal  0.237577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  34.88 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2148  pseudouridine synthase  33.7 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  37.01 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 		 469 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0063  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  35.54 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0156615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0515  pseudouridylate synthase  35.8 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  32.77 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00060  pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00103207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3541  pseudouridine synthase  35.54 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0060  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157754  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.71 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3568  pseudouridine synthase  36.71 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0161869  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0062  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3599  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0199705  unclonable  0.0000000150238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00059  hypothetical protein  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00251996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0060  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246696  normal  0.920561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.31 
 
 		 329 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0767  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.71 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000401131  normal  0.046253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0729  pseudouridine synthase  37.28 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000455311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  36.77 
 
 		 323 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.06 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0462638  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2250  pseudouridine synthase  33.71 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0568  pseudouridine synthase  38.06 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3048  pseudouridylate synthase  35.39 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  36.36 
 
 		 323 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  39.62 
 
 		 315 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.6 
 
 		 306 aa  88.6  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0050  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  36.14 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000437271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  34.54 
 
 		 326 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  39.26 
 
 		 341 aa  88.6  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1911  pseudouridine synthase, RluA family  34.09 
 
 		 356 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15666  predicted protein  33.9 
 
 		 235 aa  88.2  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.99 
 
 		 330 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  35.2 
 
 		 329 aa  88.2  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  30.39 
 
 		 313 aa  88.2  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1323  pseudouridine synthase  32.95 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>