27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15158 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_15158  predicted protein  100 
 
 
396 aa  806    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000486052  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04166  Catabolite repression protein creC [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P4R5]  31.74 
 
 
592 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04520  WD-repeat protein, putative  26.64 
 
 
733 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0145441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
919 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.71 
 
 
1348 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 
1163 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28 
 
 
924 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.49 
 
 
677 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.61 
 
 
1217 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  18.29 
 
 
1760 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.16 
 
 
642 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.62 
 
 
1357 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.99 
 
 
696 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.02 
 
 
1265 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.39 
 
 
1242 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  22.02 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24 
 
 
675 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.12 
 
 
636 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.63 
 
 
1552 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  27.5 
 
 
518 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.85 
 
 
1477 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  20.23 
 
 
1714 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12699  predicted protein  25.26 
 
 
337 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00642034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 
1344 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.8 
 
 
1623 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
1161 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
1161 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>