More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13405 on replicon NC_009371
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009371  OSTLU_13405  predicted protein  100 
 
 
466 aa  956    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  53.21 
 
 
505 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  52.23 
 
 
463 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 
483 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  53.58 
 
 
474 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  53.74 
 
 
475 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  53.36 
 
 
474 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 
483 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  53.2 
 
 
485 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  53.2 
 
 
474 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 
478 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 
474 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  52.76 
 
 
478 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  52.54 
 
 
485 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  52.19 
 
 
475 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  52.41 
 
 
475 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  52.3 
 
 
466 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  52.38 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  52.1 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  52.68 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  50.45 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  53.29 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  52.98 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  49.12 
 
 
463 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  50.45 
 
 
468 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  50.45 
 
 
468 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  49.66 
 
 
480 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  51.34 
 
 
571 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  50 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  52.42 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  50.22 
 
 
568 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  51.33 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  51.34 
 
 
560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  52.69 
 
 
472 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  50.88 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  50.55 
 
 
483 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  53.23 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  50.23 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  49.77 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  50.88 
 
 
467 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  50.66 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 
474 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  50.11 
 
 
507 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  51.22 
 
 
474 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  51.21 
 
 
471 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  49.45 
 
 
470 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 
483 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
478 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  49.88 
 
 
485 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  50.22 
 
 
471 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  50.22 
 
 
471 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  47.44 
 
 
482 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  47.66 
 
 
483 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 
475 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  47.89 
 
 
466 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 
483 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  53.04 
 
 
479 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  49.23 
 
 
479 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  47.56 
 
 
480 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  50.22 
 
 
540 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  47.74 
 
 
479 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  47.6 
 
 
470 aa  426  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  48.78 
 
 
474 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  47.74 
 
 
479 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 
470 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  47.48 
 
 
521 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  51.45 
 
 
475 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  49.06 
 
 
467 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  47.74 
 
 
479 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.1 
 
 
466 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  48.03 
 
 
474 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 
479 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  49.78 
 
 
481 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 
468 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  47.77 
 
 
471 aa  418  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  49.56 
 
 
468 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 
468 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  48.57 
 
 
468 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  47.32 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  47.89 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  49.18 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  51.22 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  47.67 
 
 
478 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
478 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  47.54 
 
 
469 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  47.45 
 
 
478 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>