50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_13201 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_13201  predicted protein  100 
 
 
322 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0928133 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25941  predicted protein  94.72 
 
 
305 aa  609  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0246971 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02439  Spindle assembly checkpoint protein SLDB [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59902]  35.24 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02770  conserved hypothetical protein  36.82 
 
 
520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32949  WD40 mitotic checkpoint-like protein similar to spleen mitotic checkpoint BUB3  32.52 
 
 
397 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77577  predicted protein  30.7 
 
 
365 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140493  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24439  predicted protein  35.08 
 
 
357 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12608  predicted protein  29.78 
 
 
345 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000194885  normal  0.0659856 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01379  Putative uncharacterized proteinSONA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74224]  30.56 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.389246  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00860  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57023  cell cycle arrest protein  24.43 
 
 
366 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.09 
 
 
740 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.88 
 
 
1510 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
1481 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.69 
 
 
1217 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.88 
 
 
1553 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.18 
 
 
919 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.43 
 
 
1236 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.04 
 
 
924 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  20.16 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.45 
 
 
1652 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 
464 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.96 
 
 
1474 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  45.16 
 
 
1766 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 
1344 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.56 
 
 
1209 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.35 
 
 
1831 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.35 
 
 
677 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 
504 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  24.54 
 
 
1484 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 
1355 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 
1334 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 
1213 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.94 
 
 
675 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  20.94 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.25 
 
 
1901 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.97 
 
 
1411 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.38 
 
 
1262 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.16 
 
 
1163 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41144  predicted protein  24.26 
 
 
1295 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16252  normal  0.0548409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 
1789 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.1 
 
 
664 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.07 
 
 
943 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.12 
 
 
1363 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  20.45 
 
 
597 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.9 
 
 
596 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  38.33 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.86 
 
 
806 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.65 
 
 
490 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  43.55 
 
 
335 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>