211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12108 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_12108  predicted protein  100 
 
 
715 aa  1481    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52285  cleavage and polyadenylation specific factor  30.95 
 
 
1001 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02250  cleavage and polyadenylation specificity factor subunit, putative  28.07 
 
 
899 aa  157  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  26.95 
 
 
767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  25.61 
 
 
793 aa  127  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03082  cleavage and polyadenylylation specificity factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09720)  27.1 
 
 
1005 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.952292  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  27.32 
 
 
602 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  24.53 
 
 
884 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  26.96 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81097  predicted protein  28.53 
 
 
934 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
642 aa  105  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  23.56 
 
 
635 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  25.21 
 
 
635 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 
635 aa  101  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 
635 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  22.37 
 
 
637 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  22.51 
 
 
635 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  22.51 
 
 
635 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 
426 aa  94.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
422 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  23.71 
 
 
647 aa  93.2  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.39 
 
 
422 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
646 aa  92  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  25.07 
 
 
636 aa  91.3  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
422 aa  90.9  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 
639 aa  89.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
639 aa  89.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  23.76 
 
 
636 aa  88.2  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 
821 aa  87  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 
634 aa  87  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  21.57 
 
 
635 aa  87  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 
640 aa  87  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  22.44 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  22.04 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  22.95 
 
 
630 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 
421 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  22.19 
 
 
629 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  23.93 
 
 
644 aa  78.2  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  23.01 
 
 
641 aa  77.8  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 
640 aa  74.3  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  23.08 
 
 
644 aa  74.3  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.4 
 
 
490 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  25.69 
 
 
470 aa  73.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.47 
 
 
636 aa  72.8  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  23.53 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  22.51 
 
 
641 aa  70.5  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  22.14 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 
531 aa  68.2  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  22.29 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  22.39 
 
 
830 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  21.86 
 
 
463 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 
467 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.41 
 
 
471 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  21.72 
 
 
469 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.82 
 
 
480 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
465 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 
454 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.82 
 
 
480 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.82 
 
 
480 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
425 aa  65.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  23.26 
 
 
397 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  21.78 
 
 
536 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1566  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
441 aa  65.1  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0665026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  21.83 
 
 
536 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
454 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  21.2 
 
 
467 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 
422 aa  64.3  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.25 
 
 
490 aa  63.9  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  22.44 
 
 
432 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  21.51 
 
 
421 aa  63.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 
464 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  20.47 
 
 
465 aa  63.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  20.11 
 
 
472 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  21.84 
 
 
441 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  21.29 
 
 
634 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4088  beta-lactamase-like  22.37 
 
 
532 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  20.9 
 
 
464 aa  62  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  23.72 
 
 
478 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  21.82 
 
 
470 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  23.72 
 
 
478 aa  61.6  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  21.73 
 
 
570 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.15 
 
 
541 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 
524 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  21.75 
 
 
544 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 
465 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.29 
 
 
466 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  21.81 
 
 
485 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3180  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 
452 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  20.83 
 
 
530 aa  60.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3061  hypothetical protein  22.93 
 
 
533 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  21.33 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.34 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>