184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1429 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1429  cell wall-associated hydrolase  100 
 
 
415 aa  849    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  37.62 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  38.24 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  33.04 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  37.74 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  37.74 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  35.04 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  31.75 
 
 
420 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  36.56 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  33.96 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  31.09 
 
 
293 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  30.97 
 
 
495 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  25.49 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  32.14 
 
 
365 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36 
 
 
1048 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  32.14 
 
 
365 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.3 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  31.86 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  33.63 
 
 
197 aa  53.5  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  32.61 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  30.21 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.75 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  30.4 
 
 
241 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
241 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  31.73 
 
 
221 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  35.35 
 
 
491 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  32.38 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  32.38 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  27.68 
 
 
280 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  30.4 
 
 
221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  31.31 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0325  cell wall-associated hydrolase  43.48 
 
 
131 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0094799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.45 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  32.46 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  32.97 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  28.8 
 
 
230 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  28.85 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  32.11 
 
 
181 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.61 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  26.29 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  27.5 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  31.13 
 
 
175 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  26.92 
 
 
257 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  33.01 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  28.99 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  32.53 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  31.65 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.34 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  29.08 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.95 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  30.93 
 
 
234 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  26.79 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  27.69 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  28.18 
 
 
308 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.67 
 
 
150 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  29.75 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  30.06 
 
 
256 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  28.23 
 
 
204 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  29.75 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  30.06 
 
 
256 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
188 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  29.81 
 
 
373 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  29.11 
 
 
248 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  34.29 
 
 
214 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  34.29 
 
 
212 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
347 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  32.63 
 
 
208 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  31.34 
 
 
372 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  34.29 
 
 
214 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  32.67 
 
 
193 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  31.63 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2672  NLP/P60  38.82 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0993565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  31.73 
 
 
205 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2717  NLP/P60 protein  38.82 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0128692  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  32.08 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  35.05 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2702  NLP/P60 protein  38.82 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  31.15 
 
 
228 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  27.12 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  32.08 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  28.12 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  32.08 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  32.08 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  32.08 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  27.12 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  27.43 
 
 
208 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  27.2 
 
 
179 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  32.99 
 
 
150 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.44 
 
 
232 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  30.89 
 
 
225 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  29.27 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>