85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0023 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000013952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  97.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  97.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  85.9 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  88.31 
 
 		 78 bp  60  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08630  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000141414  hitchhiker  0.00853262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0038  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000920806  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0008  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0031  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0042  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0022  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000255037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0070  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0076  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>