15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3586 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3586  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1211    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0749071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0800  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.271091  hitchhiker  0.0000467664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6472  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.58 
 
 		 176 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.279935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3369  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.61 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.964336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0854  sigma-70, region 4 type 2  34.78 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.699676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7716  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4499  sigma-70, region 4 type 2  31.11 
 
 		 174 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0276356  normal  0.127019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8916  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.94 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0707335  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3587  sigma-70, region 4 type 2  31.85 
 
 		 170 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1990  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.53 
 
 		 171 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5014  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.71 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.29983  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2061  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.3 
 
 		 208 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4502  sigma-70, region 4 type 2  31.5 
 
 		 190 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.34092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6553  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.68 
 
 		 186 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  normal  0.35741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0550  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.37 
 
 		 227 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>