30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3200 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3200  phosphoesterase  100 
 
 
380 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.671859  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3538  phosphoesterase  54.09 
 
 
404 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4614  phosphoesterase  54.09 
 
 
404 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4378  phosphoesterase  53.05 
 
 
367 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.614258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4632  phosphoesterase  45.14 
 
 
427 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5027  phosphoesterase  40.32 
 
 
449 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3922  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1165  phosphoesterase  30.86 
 
 
368 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5153  phosphoesterase  30.65 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3589  phosphoesterase  29.87 
 
 
337 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4773  phosphoesterase  36.42 
 
 
546 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749581  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0739  phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase  26.79 
 
 
321 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3501  phosphoesterase  28.88 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.169701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2001  phosphoesterase  27.49 
 
 
626 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322821  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3658  phosphoesterase  28.57 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2847  phosphoesterase  26.73 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0330069  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04055  acid phosphatase PHOa (AFU_orthologue; AFUA_1G03570)  23.2 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00237417  hitchhiker  0.00452392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  27.22 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0232  phosphoesterase  29.87 
 
 
260 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.583937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4401  phosphoesterase  24.72 
 
 
310 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07142  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03660)  24.84 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.851624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1007  phosphoesterase  29.34 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13339  acid phosphatase  24.34 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1617  phosphoesterase  26.52 
 
 
281 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594296  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1521  phosphoesterase  24.22 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1603  phosphatidylinositol-3-phosphate phosphatase  26.38 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.659392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1816  phosphoesterase  23.27 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.454505  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  22.82 
 
 
724 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6259  phosphoesterase  23.17 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.651293  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2127  phosphoesterase  23.18 
 
 
691 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  23.91 
 
 
438 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>