41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3076 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3076  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  43.79 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  43.33 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  40.27 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  45.98 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  34.62 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  37.75 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  37.25 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  35.9 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  34.64 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  39.07 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  49.49 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  47.13 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  37.16 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  39.07 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  45.71 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  31.76 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  42.22 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  40.24 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  55.42 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  40.19 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  39.08 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  48.19 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  30.41 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  37.97 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  31.54 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  32.45 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  44.26 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  68.97 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.228645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>