67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1673 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.58 
 
 		 402 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0254899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.75 
 
 		 403 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1688  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.1 
 
 		 436 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2289  sulfide-quinone reductase  40 
 
 		 430 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2831  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.42 
 
 		 423 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.697363  hitchhiker  0.00254819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2225  sulfide-quinone reductase  34.48 
 
 		 422 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3562  sulfide-quinone reductase  37.25 
 
 		 426 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 426 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.552628  normal  0.391539 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0055  sulfide:quinone oxidoreductase  37.91 
 
 		 423 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2039  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.65 
 
 		 432 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3378  sulfide-quinone reductase  37.42 
 
 		 429 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1390  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.65 
 
 		 435 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0862437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4096  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.96 
 
 		 430 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2155  sulfide-quinone reductase  33.99 
 
 		 424 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1326  sulfide-quinone reductase  38.56 
 
 		 427 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049484  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3722  sulfide-quinone reductase  37.01 
 
 		 428 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.094344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2477  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3722  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.91 
 
 		 434 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.860227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0239  sulfide-quinone reductase  35.06 
 
 		 426 aa  94.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 		 425 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000167725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1170  sulfide-quinone reductase  32.93 
 
 		 435 aa  90.9  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0125  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.76 
 
 		 428 aa  90.1  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 428 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1792  sulfide-quinone reductase, putative  39.22 
 
 		 434 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.22 
 
 		 434 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.304083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2448  sulfide-quinone reductase  32.9 
 
 		 427 aa  88.2  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.650431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1163  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1529  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.94 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1407  sulfide-quinone reductase  27.45 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2059  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.32 
 
 		 409 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.761901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1517  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.71 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4075  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.38 
 
 		 388 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1127  sulfide-quinone reductase  25.97 
 
 		 408 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0922  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.67 
 
 		 406 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2082  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.32 
 
 		 379 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.107005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0165  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.56 
 
 		 379 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.934981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3933  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.75 
 
 		 388 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.39 
 
 		 414 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.94 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1203  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 		 413 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.223151  normal  0.0279723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1267  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), flavoprotein subunit  31.17 
 
 		 437 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.627541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0486  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.56 
 
 		 397 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.409474  normal  0.0139232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0071  sulfide-quinone reductase, putative  35.23 
 
 		 484 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00637457  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1453  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.91 
 
 		 386 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.85 
 
 		 383 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.755608  normal  0.657497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0882  sulfide-quinone reductase, putative  25.16 
 
 		 484 aa  45.1  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.638207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0298  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.74 
 
 		 382 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000682999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4267  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.05 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4036  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 		 387 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3437  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.03 
 
 		 379 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000631471  normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.38 
 
 		 384 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00637621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1347  sulfide-quinone reductase, putative  26.62 
 
 		 484 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230.1  quinone reductase  37.7 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3348  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 		 457 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881293  normal  0.729008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.87 
 
 		 358 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1802  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.69 
 
 		 392 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00556002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.18 
 
 		 457 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2750  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.45 
 
 		 483 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.340366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1945  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 		 435 aa  42.4  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.333887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  47.73 
 
 		 483 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.758054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 412 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3718  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.9 
 
 		 444 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4902  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.73 
 
 		 504 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122088  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0353  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.56 
 
 		 384 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.12 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>