More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1658 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  71.66 
 
 		 445 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  71.91 
 
 		 445 aa  659    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  70.09 
 
 		 452 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  74.61 
 
 		 445 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  68.23 
 
 		 447 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  73.3 
 
 		 444 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  71.05 
 
 		 449 aa  675    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  71.75 
 
 		 447 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  75.11 
 
 		 446 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  68.37 
 
 		 449 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  70.79 
 
 		 445 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  66.96 
 
 		 451 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  71.21 
 
 		 448 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  71.21 
 
 		 448 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  69.66 
 
 		 447 aa  639    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  69.96 
 
 		 447 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  71.01 
 
 		 445 aa  656    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  70.44 
 
 		 449 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  100 
 
 		 458 aa  941    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  71.21 
 
 		 448 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  72.61 
 
 		 449 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  69.2 
 
 		 449 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  70.32 
 
 		 449 aa  640    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  68.31 
 
 		 449 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  69.73 
 
 		 447 aa  639    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  71.97 
 
 		 449 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  67.33 
 
 		 453 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  67.19 
 
 		 449 aa  628  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  66.74 
 
 		 448 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14650  glutamate dehydrogenase  67.42 
 
 		 451 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.287682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  66.06 
 
 		 449 aa  618  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  65.38 
 
 		 449 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  69.44 
 
 		 456 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  64.93 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  64.29 
 
 		 449 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  64.06 
 
 		 449 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  64.06 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  63.62 
 
 		 448 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  65.31 
 
 		 448 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  64.71 
 
 		 450 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  63.68 
 
 		 446 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04440  glutamate dehydrogenase  67.94 
 
 		 446 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  63.49 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  62.28 
 
 		 451 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  63.86 
 
 		 448 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  63.64 
 
 		 448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  64.84 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  61.5 
 
 		 454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  63.04 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  62.53 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  61.09 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  60.54 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  60.64 
 
 		 447 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  61.96 
 
 		 445 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  60.78 
 
 		 443 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  59.14 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  59.01 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  58 
 
 		 451 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  57.37 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  60.55 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  61.64 
 
 		 449 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  59.5 
 
 		 438 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  57.87 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  60.18 
 
 		 450 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  56.88 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  59.73 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  60.32 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  58.14 
 
 		 443 aa  528  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  58.18 
 
 		 451 aa  525  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  59.5 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  59.91 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  58.17 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  58.07 
 
 		 445 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  59.51 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  59.96 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 449 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  58.84 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  60 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  56.85 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  58.77 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  57.94 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  58.77 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  59.01 
 
 		 447 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  59.28 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  59.28 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  57.05 
 
 		 446 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  59.51 
 
 		 447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  58.77 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  58.33 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  56.53 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  58.45 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  59.28 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  59.01 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  59.28 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  55.9 
 
 		 452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.56 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  58.56 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  56.15 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  58.78 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>