93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0951 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0951  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1997  UspA domain-containing protein  50.5 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.2 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.46 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  31.5 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  35.1 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.19 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  28.8 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1638  UspA domain protein  33.77 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  31.3 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  57  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  30.17 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  32.76 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  32.38 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  28.84 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  30.74 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  29.11 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 146 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.59 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  33.54 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  28.86 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  31.51 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.53 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.51 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  28.16 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  29.58 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  32.87 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  35.26 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  28.22 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  27.81 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0660  UspA domain protein  29.63 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  32.54 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  25.86 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.59 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  30.37 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  25.52 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  32.86 
 
 		 283 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  29.48 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  29.82 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  29.48 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.2 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  26.09 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.4 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.84 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  27.47 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.75 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 144 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 148 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  28.05 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 138 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.49 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.28 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  29.24 
 
 		 281 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.22 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>