More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2109 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0652  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.92 
 
 
998 aa  907    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2109  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  100 
 
 
902 aa  1826    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.73263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2674  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  56.65 
 
 
983 aa  962    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3068  pyruvate dehydrogenase complex, E2 and E3 components  56.65 
 
 
983 aa  962    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0400  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.82 
 
 
455 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04551  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.31 
 
 
455 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04661  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.29 
 
 
455 aa  243  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04241  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.53 
 
 
455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.57 
 
 
470 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
470 aa  239  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
470 aa  239  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
470 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  237  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
470 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.2 
 
 
593 aa  235  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.01 
 
 
470 aa  235  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
470 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
479 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.72 
 
 
489 aa  231  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
480 aa  231  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
480 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
481 aa  228  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1739  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.53 
 
 
456 aa  228  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
480 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.54 
 
 
470 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
480 aa  227  8e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.31 
 
 
467 aa  227  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
467 aa  226  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.19 
 
 
479 aa  225  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04561  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.51 
 
 
456 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.852087  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21291  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.65 
 
 
439 aa  225  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.372749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 
479 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.51 
 
 
481 aa  224  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.46 
 
 
479 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4977  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.56 
 
 
432 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
463 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 
466 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.27 
 
 
454 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04031  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.02 
 
 
456 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.261973  normal  0.760936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.43 
 
 
463 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
467 aa  221  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  34.88 
 
 
462 aa  221  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.22 
 
 
468 aa  220  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.44 
 
 
470 aa  220  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.3 
 
 
591 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 
479 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1831  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.3 
 
 
431 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.63 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.08 
 
 
479 aa  218  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.54 
 
 
494 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1068  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.24 
 
 
431 aa  218  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0808214  hitchhiker  0.00512837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 
468 aa  218  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.29 
 
 
465 aa  217  7e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
474 aa  217  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.78 
 
 
473 aa  217  9e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  30.4 
 
 
466 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
474 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  31.39 
 
 
507 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 
450 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
474 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
475 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
474 aa  215  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1261  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.45 
 
 
426 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.4471  hitchhiker  0.000962445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
474 aa  215  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  35.53 
 
 
481 aa  215  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1231  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.45 
 
 
426 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3176  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.6 
 
 
432 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
605 aa  214  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.5 
 
 
593 aa  214  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.84 
 
 
546 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 
477 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 
590 aa  213  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
595 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.92 
 
 
595 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.38 
 
 
466 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.71 
 
 
468 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
467 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.27 
 
 
610 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
589 aa  212  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
463 aa  212  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 
474 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.05 
 
 
474 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
685 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
467 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
495 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
495 aa  211  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.16 
 
 
607 aa  211  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
474 aa  210  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
474 aa  210  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
474 aa  210  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
474 aa  210  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
474 aa  210  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>