13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1506 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0547  hypothetical protein  60.29 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000844189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2368  hypothetical protein  59.32 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00633601  normal  0.0946995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2720  hypothetical protein  49.09 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000297468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0768  hypothetical protein  38.57 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3396  hypothetical protein  37.7 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  86.21 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0520  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.253253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  39.58 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0167  hypothetical protein  36.92 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2822  protein of unknown function UPF0150  28.99 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 165 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>