More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_AR0013 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  95.65 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  95.65 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0014  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.207182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0028  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0034  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0065  tRNA-Ile  94.37 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00143134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0035  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.849815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0047  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000593812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0017  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000136136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0058  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00171421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4265  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000229393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4204  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt40  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt40  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  97.6  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0149  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0011  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000846583  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0011  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0062166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0160  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0152441  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0035  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0005  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000353567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0005  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000168156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>