44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2600 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2600  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.716222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2736  hypothetical protein  52.53 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.816191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6319  hypothetical protein  45.45 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1760  hypothetical protein  45.45 
 
 
162 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4315  hypothetical protein  43.36 
 
 
158 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581556  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6280  hypothetical protein  51.06 
 
 
149 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5057  hypothetical protein  44.44 
 
 
159 aa  84.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1501  hypothetical protein  43.88 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787419  normal  0.0723582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1773  hypothetical protein  45.45 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0492  hypothetical protein  35.44 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.702213  normal  0.0712002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0503  hypothetical protein  42.31 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14380  hypothetical protein  43.75 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0723712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0651  hypothetical protein  44.21 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0819  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0009  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2396  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.344878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2680  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0982  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0281  hypothetical protein  41.05 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0823  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.253243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1239  hypothetical protein  41.94 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1845  hypothetical protein  37.76 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3527  hypothetical protein  37.25 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0864  hypothetical protein  37.25 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3656  hypothetical protein  37.25 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2754  P-18 protein  37.04 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0515  hypothetical protein  29.56 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0489  P-18 protein  30.61 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0994  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4897  hypothetical protein  30.18 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4950  hypothetical protein  30.18 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4863  hypothetical protein  30.18 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4956  hypothetical protein  30.18 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4796  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.608299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3695  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000118901  hitchhiker  0.00917885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4592  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000005798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4953  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000310111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4900  hypothetical protein  29.37 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3637  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000262647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04203  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04237  hypothetical protein  29.37 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00255693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4905  hypothetical protein  29.59 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000354937  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5873  hypothetical protein  28.67 
 
 
165 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.002117  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1916  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.274823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>