More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1516 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1516  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
326 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.9 
 
 
325 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550418  normal  0.0765759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.9 
 
 
325 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2499  thioredoxin-disulfide reductase  41.67 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.87 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  41.96 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.95 
 
 
302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1613  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.72 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.32 
 
 
307 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.63 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.02 
 
 
348 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  28.7 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.3 
 
 
551 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  26.83 
 
 
323 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  28.94 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0975  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.49 
 
 
320 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000415137  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  28.13 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7926  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
331 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.949159  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.33 
 
 
579 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  26.44 
 
 
306 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  31.61 
 
 
331 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  28.71 
 
 
348 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  28.97 
 
 
327 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  26.06 
 
 
306 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  28.97 
 
 
319 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  27.69 
 
 
330 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  29.13 
 
 
346 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  29.73 
 
 
313 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1021  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.1 
 
 
358 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.664925  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  30.94 
 
 
305 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  25.85 
 
 
306 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  26.57 
 
 
308 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  27.61 
 
 
302 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  27.13 
 
 
311 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  29.88 
 
 
330 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  28.39 
 
 
309 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  30 
 
 
348 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  27.41 
 
 
306 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  28.33 
 
 
309 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  28.35 
 
 
331 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  29.49 
 
 
310 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  29.39 
 
 
297 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  26.14 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  30.94 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  27.61 
 
 
310 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  28.92 
 
 
333 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  28.92 
 
 
333 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  28.92 
 
 
333 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  28.25 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  29.05 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.21 
 
 
602 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  28.39 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  27.3 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  31.8 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  25.08 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  29.18 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  27.91 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  27.99 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  26.52 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0929  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.13 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  28.95 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  29.58 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  29.63 
 
 
329 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  26.67 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  28.31 
 
 
333 aa  94  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  26.35 
 
 
317 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  31.7 
 
 
317 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  30.23 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  24.68 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  25.88 
 
 
550 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  25.24 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  26.35 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  27.44 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  26.35 
 
 
327 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  29.48 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.54 
 
 
427 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.07 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  27.15 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1396  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.28 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5295  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  27.1 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.69 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3112  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.56 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  24.84 
 
 
320 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  26.28 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  26.58 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0773  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.91 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.97 
 
 
361 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0648592  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  26.73 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
547 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  25.57 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  26.33 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  24.85 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.46 
 
 
407 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  26.92 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.13 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  24.62 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  28.83 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.39 
 
 
299 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3154  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
300 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>