More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0924 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
666 aa  1349    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  47.1 
 
 
668 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  49.34 
 
 
663 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  46.07 
 
 
685 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  49.06 
 
 
678 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  43.18 
 
 
658 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  43.58 
 
 
787 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  43.38 
 
 
838 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  42.12 
 
 
886 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  41.58 
 
 
864 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  43.39 
 
 
840 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  40.19 
 
 
848 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  42.75 
 
 
833 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  43.39 
 
 
845 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0863  preprotein translocase subunit SecA  41.17 
 
 
824 aa  424  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0619112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  39.94 
 
 
903 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  39.87 
 
 
845 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  40.45 
 
 
897 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  42.58 
 
 
844 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  42.06 
 
 
796 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  39.94 
 
 
911 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  38.69 
 
 
992 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  40.28 
 
 
896 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.19 
 
 
896 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1043  preprotein translocase subunit SecA  39.93 
 
 
857 aa  422  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  40.1 
 
 
787 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  39.8 
 
 
939 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  38.45 
 
 
912 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  39.31 
 
 
916 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0183  protein translocase subunit secA  42.04 
 
 
803 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 
913 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  41.05 
 
 
859 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  40.8 
 
 
858 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  38.97 
 
 
910 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 
915 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  40.17 
 
 
916 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  40.17 
 
 
916 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  40.76 
 
 
912 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  39.67 
 
 
911 aa  416  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  39.74 
 
 
900 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  42.45 
 
 
830 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  40.51 
 
 
799 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  40.91 
 
 
863 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  42.4 
 
 
840 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  41.64 
 
 
868 aa  412  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  39.51 
 
 
1075 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 
907 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0589  preprotein translocase subunit SecA  39.2 
 
 
853 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  40.62 
 
 
884 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  39.03 
 
 
902 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  39.63 
 
 
934 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1321  protein translocase subunit secA  39.93 
 
 
788 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  40.1 
 
 
902 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3049  preprotein translocase subunit SecA  40.25 
 
 
787 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1061  preprotein translocase subunit SecA  39.46 
 
 
788 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000383291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  38.86 
 
 
912 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0952  preprotein translocase subunit SecA  39.18 
 
 
911 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0825875  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  40.46 
 
 
862 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1165  preprotein translocase subunit SecA  39.72 
 
 
862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1388  preprotein translocase, SecA subunit  41.07 
 
 
859 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  38.61 
 
 
909 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0838  preprotein translocase subunit SecA  39.32 
 
 
788 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  39.47 
 
 
934 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0786  preprotein translocase subunit SecA  39.32 
 
 
788 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4094  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 
913 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.843066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  37.44 
 
 
968 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  38.67 
 
 
924 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  40.89 
 
 
914 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4428  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 
934 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0882  preprotein translocase subunit SecA  39.32 
 
 
788 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 
836 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  39.61 
 
 
909 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  40.95 
 
 
910 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.28 
 
 
912 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  37.82 
 
 
1009 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1345  preprotein translocase subunit SecA  38.79 
 
 
911 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478182  decreased coverage  0.000123273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  41.19 
 
 
844 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 
909 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  39.34 
 
 
934 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  39.34 
 
 
893 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  38.4 
 
 
903 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0777  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 
843 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  40.1 
 
 
904 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  38.17 
 
 
921 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  38.2 
 
 
866 aa  405  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  40.11 
 
 
862 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  38.25 
 
 
909 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1563  preprotein translocase subunit SecA  40.62 
 
 
662 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  38.08 
 
 
899 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  39.87 
 
 
896 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4379  preprotein translocase subunit SecA  38.79 
 
 
939 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143191  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  40.72 
 
 
914 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  39.43 
 
 
908 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0794  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 
843 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 
908 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  39.74 
 
 
908 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1705  preprotein translocase subunit SecA  40.72 
 
 
849 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0711  preprotein translocase subunit SecA  39.15 
 
 
787 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.752674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 
908 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  41.87 
 
 
837 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>