More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0860 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0860  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2547  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  77.49 
 
 
236 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.650882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2862  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  77.06 
 
 
236 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1824  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.98 
 
 
233 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2148  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.98 
 
 
233 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4492  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.98 
 
 
233 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4359  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.98 
 
 
233 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1993  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.55 
 
 
233 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.17727  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4364  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5589  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1427  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  75.98 
 
 
233 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2322  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.67 
 
 
233 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2149  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.55 
 
 
233 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3603  succinate dehydrogenase subunit B  75.55 
 
 
234 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2483  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.571156  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2703  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  75.11 
 
 
234 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3314  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.67 
 
 
233 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3035  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  75.11 
 
 
234 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0502  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1832  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0687066  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1746  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0790  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0832878  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5837  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0362  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein  75.55 
 
 
235 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0663  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.67 
 
 
233 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4645  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0902165  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4430  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1624  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3830  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3937  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3591  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130742  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2167  succinate dehydrogenase subunit B  75.55 
 
 
234 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2331  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2469  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  74.24 
 
 
233 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2201  succinate dehydrogenase subunit B  75.11 
 
 
233 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182977  normal  0.70745 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5498  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
236 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2424  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  74.35 
 
 
234 aa  367  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2513  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  74.24 
 
 
235 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1323  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
235 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0573878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2361  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  72.84 
 
 
232 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6506  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
235 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377091  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6095  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
235 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4351  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  74.67 
 
 
234 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1185  succinate dehydrogenase subunit B  70.56 
 
 
231 aa  364  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6853  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  76.42 
 
 
234 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.522484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5773  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  72.93 
 
 
235 aa  363  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2892  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  75.11 
 
 
234 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0761  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  72.93 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1798  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  70.74 
 
 
234 aa  353  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1998  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
237 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1395  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
235 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431084  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2285  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
237 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1019  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
235 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1060  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  72.05 
 
 
234 aa  352  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.564724  normal  0.0724553 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3178  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
237 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1307  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.87 
 
 
237 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3049  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  69.43 
 
 
237 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0125  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  68.26 
 
 
231 aa  349  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2516  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.52 
 
 
235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2509  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.52 
 
 
235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0253294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1835  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.52 
 
 
235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0785483  normal  0.205707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2629  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.52 
 
 
235 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2286  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  74.35 
 
 
234 aa  345  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2796  succinate dehydrogenase subunit B  74.35 
 
 
234 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.218703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2270  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.09 
 
 
235 aa  344  8e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0879984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.24 
 
 
235 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1634  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.24 
 
 
235 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.241417  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1709  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.24 
 
 
235 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0856361  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1426  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.09 
 
 
235 aa  342  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0151573  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1929  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.67 
 
 
235 aa  342  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  68.4 
 
 
231 aa  341  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2344  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.24 
 
 
235 aa  341  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0657231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1836  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.09 
 
 
235 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0319754  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2184  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  64.81 
 
 
235 aa  339  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2218  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  67.53 
 
 
235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1654  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.24 
 
 
235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.224202  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2801  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  68.24 
 
 
234 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.261563  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1787  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  64.38 
 
 
235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.177306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2815  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  63.95 
 
 
235 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.171032  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1383  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.96 
 
 
238 aa  332  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2969  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.96 
 
 
238 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.658603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2882  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.96 
 
 
238 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1216  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  67.98 
 
 
236 aa  331  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01874  succinate dehydrogenase catalytic subunit  65.38 
 
 
236 aa  331  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000253868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1266  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  66.67 
 
 
238 aa  329  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1481  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  63.68 
 
 
233 aa  329  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1798  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  64.96 
 
 
236 aa  329  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0325296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00684  succinate dehydrogenase, FeS subunit  65.11 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00673  hypothetical protein  65.11 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1674  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  63.68 
 
 
236 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0772  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0643  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2931  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0737  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.959828  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0751  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0816  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  65.11 
 
 
238 aa  325  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.715359  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01354  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  63.68 
 
 
238 aa  324  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3690  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  64.07 
 
 
235 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2911  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  65.11 
 
 
238 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.327846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0264  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  62.72 
 
 
236 aa  323  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>