165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0802 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0802  NapC/NirT cytochrome c-like  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1085  NapC/NirT cytochrome c-like  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2659  NapC/NirT cytochrome c-like  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0895  NapC/NirT cytochrome c-like  67.84 
 
 
219 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.356443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0807  cytochrome c-type protein  39.63 
 
 
378 aa  97.8  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  31.49 
 
 
603 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4075  NapC/NirT cytochrome c-like  34.91 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  35.59 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  36.31 
 
 
368 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  33.73 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  33.51 
 
 
392 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  34.12 
 
 
392 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.95 
 
 
394 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  35.15 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  35.71 
 
 
364 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  31.95 
 
 
394 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  33.51 
 
 
392 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.95 
 
 
394 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.95 
 
 
394 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05451  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  32.12 
 
 
361 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.95 
 
 
394 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  32.94 
 
 
366 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  32.18 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  38.1 
 
 
385 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  34.73 
 
 
391 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  32.34 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  32.34 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  32.74 
 
 
237 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  34.51 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  32.34 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  31.74 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  34.51 
 
 
386 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.1 
 
 
390 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  32.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  31.1 
 
 
390 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  30.59 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  32.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  31.1 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  30.72 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  32.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  32.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  32.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  31.1 
 
 
390 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  31.1 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4367  putative cytochrome c-type protein  35.67 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4756  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  35.8 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  unclonable  0.0000000129737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  34.51 
 
 
366 aa  82  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  31.4 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  34.51 
 
 
366 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  34.51 
 
 
366 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  33.8 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  31.14 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  33.8 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  30.49 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  34.93 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  30.49 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  33.8 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  29.7 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  33.8 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2172  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type protein NapC  31.14 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  32.92 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1672  cytochrome c-type protein  29.94 
 
 
389 aa  79  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  31.14 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  29.41 
 
 
392 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  28.74 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.82 
 
 
392 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  29.52 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.82 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.82 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.82 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  28.24 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4118  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  32.78 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.24 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.24 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  27.65 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3992  hypothetical protein  32.78 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0212723  normal  0.240868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0369  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  31.98 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  30.77 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  28.24 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  30 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  31.14 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1947  nitrate/TMAO reductase  31.52 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3484  cytochrome c-type protein NapC  32.05 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382018  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  29.41 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1017  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  33.14 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2797  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  27.65 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  28.74 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2364  cytochrome c-type protein NapC  29.41 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1860  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  30.95 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  29.27 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05375  cytochrome c-type protein NapC  30.95 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000515  cytochrome c-type protein NapC  30.91 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>