28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0018 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0018  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
188 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  36.36 
 
 
407 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.92 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.68 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 
565 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.08 
 
 
810 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
804 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
1276 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
657 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
562 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
1049 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
878 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  40.74 
 
 
623 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1459  hypothetical protein  32.73 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
314 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
200 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
3035 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
471 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2419  hypothetical protein  29.31 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562404  normal  0.124361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 
722 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.5 
 
 
730 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
467 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.75 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  33.9 
 
 
584 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
1450 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>