28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0374 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0374  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 		 105 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0415  50S ribosomal protein L12P  64.81 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0860  ribosomal protein 60S  56.36 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3520  ribosomal protein 60S  60 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0878  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0654  50S ribosomal protein L12P  47.62 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00068543  normal  0.300749 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1637  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.461477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1709  50S ribosomal protein L12P  53.57 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.49137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1699  50S ribosomal protein L12P  49.23 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0899103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1519  ribosomal protein 60S  60 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0621  50S ribosomal protein L12P  53.57 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1948  50S ribosomal protein L12P  61.54 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0442001  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0720  50S ribosomal protein L12P  53.57 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0784  50S ribosomal protein L12P  51.79 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0256  50S ribosomal protein L12P  58.82 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2249  50S ribosomal protein L12P  55.56 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  unclonable  0.0000000000341588  normal  0.119729 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1314  ribosomal protein 60S  52.73 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2533  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386824  normal  0.269455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0165  50S ribosomal protein L12P  53.7 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.589504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0612  50S ribosomal protein L12P  58 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000227092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0187  50S ribosomal protein L12P  56.36 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2184  ribosomal protein 60S  58 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.603129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1579  50S ribosomal protein L12P  51.85 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00723578  hitchhiker  0.00569921 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1419  50S ribosomal protein L12P  48.15 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.893644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0695  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1261  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0732344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1415  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1271  50S ribosomal protein L12P  59.18 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>