12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0139 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0139  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1191    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000152944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1515  hypothetical protein  29.33 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1133  hypothetical protein  31.08 
 
 
318 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.364834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3932  hypothetical protein  30.93 
 
 
434 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0270358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1717  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsB  24.14 
 
 
467 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.884908  hitchhiker  0.00000000153114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1388  hypothetical protein  28 
 
 
317 aa  53.9  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.882793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0974  hypothetical protein  27.03 
 
 
322 aa  51.6  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0024  hypothetical protein  20.67 
 
 
502 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1023  hypothetical protein  25.51 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.262732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  18.32 
 
 
681 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0023  hypothetical protein  23.28 
 
 
511 aa  47.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1485  hypothetical protein  26.85 
 
 
318 aa  47.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>