287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0134 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0134  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000035681 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  27.78 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1412  putative formyltransferase  28.67 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  30.88 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  29.5 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  34.67 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0432  putative formyltransferase  26.28 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2980  putative formyltransferase  25.18 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  25.63 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  25.63 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1095  formyl transferase domain protein  24.52 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  23.56 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  23.94 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1320  putative formyltransferase  29.73 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.901724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  25.13 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5938  formyl transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723726  normal  0.313498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1256  putative formyltransferase  35.71 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201049  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2599  formyl transferase domain protein  29.79 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1195  putative formyltransferase  35.71 
 
 		 313 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  0.263795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  30.99 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.81 
 
 		 668 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  30.99 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  24.77 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0884  putative formyltransferase  23.97 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686111  hitchhiker  0.000000271321 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0279  formyl transferase domain protein  25 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  28.92 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  27.5 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  22.14 
 
 		 316 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  34.33 
 
 		 313 aa  52.4  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  23.61 
 
 		 314 aa  52.4  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  27.19 
 
 		 318 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  22.34 
 
 		 309 aa  52.4  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  25.44 
 
 		 313 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1777  methionyl-tRNA formyltransferase  25.21 
 
 		 332 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  29.06 
 
 		 317 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3634  putative formyltransferase  25.35 
 
 		 298 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.374471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  34.78 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  21.26 
 
 		 323 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  25.62 
 
 		 308 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  30.68 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0691  formyl transferase domain-containing protein  25.77 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1885  putative formyltransferase  23.53 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244317 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  30.68 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  26.54 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 		 8915 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  26.97 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 		 327 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3975  putative formyltransferase  32.86 
 
 		 311 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  30.49 
 
 		 314 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  19.19 
 
 		 334 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2191  putative formyltransferase  28.74 
 
 		 315 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00205892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  24 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  26.97 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  26.95 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1799  putative formyltransferase  23.94 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092642 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1392  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2403  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5162  putative formyltransferase  31.88 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1154  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  21.83 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4591  putative formyltransferase  27.91 
 
 		 308 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00877136  hitchhiker  0.00199709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  28.83 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2277  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2239  putative formyltransferase  27.59 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  23.78 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1882  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295959  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09171  putative methionyl-tRNA formyltransferase  26.89 
 
 		 328 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0015  putative formyltransferase  27.27 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  32.84 
 
 		 317 aa  48.5  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2388  putative formyltransferase  23.24 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.482791  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  29.55 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  24.1 
 
 		 326 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6218  putative formyltransferase  23.94 
 
 		 315 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  23.68 
 
 		 346 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1799  putative formyltransferase  22.79 
 
 		 315 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1861  putative formyltransferase  23.94 
 
 		 315 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0924  putative formyltransferase  30.43 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.343946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1771  putative formyltransferase  22.79 
 
 		 315 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1412  putative formyltransferase  28.99 
 
 		 315 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1505  methionyl-tRNA formyltransferase  27.38 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.337969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.71 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  23.73 
 
 		 314 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  23.68 
 
 		 328 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  28.99 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  23.37 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.71 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  23.49 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  23.68 
 
 		 328 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  25.86 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  25.98 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  21.64 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 		 320 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  23.33 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  27.96 
 
 		 663 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  25.86 
 
 		 309 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>