More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0085 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0085  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 388 aa  807    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.486268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  60.16 
 
 		 385 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  59.84 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 383 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  59.48 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.72 
 
 		 383 aa  494  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  61.72 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.98 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 403 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 383 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 383 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  59.29 
 
 		 397 aa  484  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  61.3 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 		 391 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  58.73 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 384 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  58.73 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  57.33 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  59.33 
 
 		 388 aa  479  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  60.16 
 
 		 381 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  58.59 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  60.21 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  58.72 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  59.38 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  57.93 
 
 		 396 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  60.67 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  58.33 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  58.12 
 
 		 402 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  57.95 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  56.07 
 
 		 385 aa  474  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 382 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  58.33 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.71 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  56.53 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  58.07 
 
 		 382 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  58.08 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  56.63 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1676  methionine adenosyltransferase  61.28 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  58.48 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  55.33 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0030  S-adenosylmethionine synthetase  59.74 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>