More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4294 on replicon NC_013925
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013925  Nmag_4294  integrase family protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0264131  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3588  integrase family protein  47.67 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2809  integrase family protein  47.15 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5287  integrase family protein  40.72 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  33.53 
 
 		 380 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  33.73 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.52 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.26 
 
 		 328 aa  62  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.47 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.47 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.38 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3658  phage integrase/site-specific recombinase  42.86 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.11 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.96 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  33.67 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.72 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.3 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.44 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  31.11 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  32.76 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  31.18 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  34.12 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  28.02 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.1 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.72 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  30.99 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  31.16 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  33.53 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  30.69 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  33.73 
 
 		 317 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.59 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  33.72 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.64 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.65 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.43 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 		 304 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  33.53 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  32.56 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  32.11 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  31.18 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  29.35 
 
 		 336 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  28.42 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.73 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  32.56 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  29.71 
 
 		 310 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28 
 
 		 301 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.56 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  30.27 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0624  integrase family protein  33.33 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.995528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 294 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.95 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.17 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  29.82 
 
 		 302 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  32.14 
 
 		 329 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.17 
 
 		 307 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  28.89 
 
 		 300 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  30.57 
 
 		 340 aa  52.8  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 298 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  25.13 
 
 		 193 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.81 
 
 		 302 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>