23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4131 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4131  ribosomal protein S14  100 
 
 
65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2306  30S ribosomal protein S14P  54.84 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0224  ribosomal protein S14  53.23 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2232  ribosomal protein S14  53.23 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2435  30S ribosomal protein S14P  58.18 
 
 
57 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1842  ribosomal protein S14  64.29 
 
 
57 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0096  30S ribosomal protein S14P  63.89 
 
 
50 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000254546  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1714  ribosomal protein S14  56.82 
 
 
47 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0015  30S ribosomal protein S14P  54.55 
 
 
50 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.67188e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0578  ribosomal protein S14  47.37 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0095  30S ribosomal protein S14P  52.27 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.450951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0165  30S ribosomal protein S14P  51.28 
 
 
53 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000451601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0658  30S ribosomal protein S14P  51.28 
 
 
53 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  decreased coverage  0.0000578449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1260  30S ribosomal protein S14P  51.28 
 
 
53 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0456  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
51 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169486  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0546  30S ribosomal protein S14P  50 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355723  normal  0.314336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2239  30S ribosomal protein S14P  52.78 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000503282  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0724  30S ribosomal protein S14P  51.28 
 
 
53 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159665  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1507  ribosomal protein S14  52.78 
 
 
53 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.59133e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1398  30S ribosomal protein S14P  43.59 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1764  ribosomal protein S14  51.43 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.351928  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31044  RPS29A; ribosomal protein S29A (S36A) (YS29)  54.05 
 
 
56 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167387  normal  0.57563 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1864  30S ribosomal protein S14P  45.71 
 
 
54 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>