96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3616 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3616  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  100 
 
 
301 aa  615  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0712  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  56.49 
 
 
287 aa  335  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0058  formyl transferase domain protein  33.33 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0379869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1070  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  30.18 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.520148 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  23.21 
 
 
182 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  29.27 
 
 
326 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  21.68 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  20.93 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  23.88 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  25.55 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.65 
 
 
200 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  24.09 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  25.56 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  25.56 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  27.33 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  25.96 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  22.54 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  24.8 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.1 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.1 
 
 
204 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  32.48 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  25.17 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.06 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  25.55 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  24.58 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  26.32 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  24.19 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2980  putative formyltransferase  28.47 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 
313 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0915  hypothetical protein  29.7 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4017  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.46 
 
 
660 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296213  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  23.33 
 
 
181 aa  46.2  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  25.77 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  25.68 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2129  methionyl-tRNA formyltransferase-like  26.83 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.96137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  24.18 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  26.39 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.23 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  26.96 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.23 
 
 
188 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  26.56 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  27.97 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  24.04 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.46 
 
 
663 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  28.03 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2527  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.19 
 
 
660 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  33.98 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  27.59 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0065  methionyl-tRNA formyltransferase  23.28 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  24.04 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2643  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.19 
 
 
660 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2435  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.19 
 
 
660 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  24.24 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1233  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  24.44 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000667548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  28.33 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2484  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.19 
 
 
660 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  24.19 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  26.45 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.43 
 
 
188 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  26.27 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0517  formyltransferase, putative  24.79 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  27.66 
 
 
185 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  24.48 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  23.94 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0521  putative formyltransferase  24.79 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  25.42 
 
 
212 aa  43.9  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2539  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  27.52 
 
 
660 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  26.61 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.45 
 
 
198 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  26.61 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.48 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0474  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  24.11 
 
 
192 aa  43.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.462514  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  25.2 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  29.83 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.01 
 
 
668 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  25.93 
 
 
336 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  22.4 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4638  methionyl-tRNA formyltransferase  23.53 
 
 
357 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.857325  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2588  formyl transferase domain protein  22.14 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1943  formyl transferase domain protein  33.33 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  27.91 
 
 
664 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>