166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0732 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0732  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  100 
 
 		 418 aa  855    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2766  ribulose bisophosphate carboxylase  67.92 
 
 		 423 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0553432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1084  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  46.08 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.518346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0902  ribulose bisophosphate carboxylase  43.72 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1105  ribulose bisophosphate carboxylase  43.32 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1863  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  45.88 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1325  ribulose bisophosphate carboxylase  42.89 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1227  ribulose bisophosphate carboxylase  45.77 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1616  ribulose-bisphosphate carboxylase  44.44 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.43252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0258  Ribulose-bisphosphate carboxylase  42.39 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2315  ribulose-bisphosphate carboxylase  42.18 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0558  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  41.63 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0297277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3751  ribulose bisophosphate carboxylase  38.92 
 
 		 488 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2929  ribulose bisophosphate carboxylase  38.92 
 
 		 489 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.880284  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4049  ribulose bisophosphate carboxylase  38.92 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1699  ribulose bisophosphate carboxylase  40.34 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1918  ribulose bisophosphate carboxylase  39.41 
 
 		 488 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3032  ribulose bisophosphate carboxylase  39.9 
 
 		 488 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3924  ribulose bisophosphate carboxylase  38.48 
 
 		 486 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1655  Ribulose-bisphosphate carboxylase  39.66 
 
 		 482 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.471875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1747  ribulose bisophosphate carboxylase  38.01 
 
 		 485 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1327  ribulose bisophosphate carboxylase  37.29 
 
 		 523 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180974  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1195  ribulose bisophosphate carboxylase  38.55 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0459854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0451  ribulose bisophosphate carboxylase  37.68 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2782  ribulose bisophosphate carboxylase  38.42 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3964  ribulose bisophosphate carboxylase  37.59 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.909404  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6397  ribulose bisophosphate carboxylase  37.59 
 
 		 486 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3722  ribulose bisophosphate carboxylase  37.35 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0880816  hitchhiker  0.00193394 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3255  Ribulose-bisphosphate carboxylase  39.42 
 
 		 480 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.936346  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2712  ribulose bisophosphate carboxylase  37.53 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0824  ribulose bisophosphate carboxylase  39.41 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2453  ribulose bisophosphate carboxylase  38.88 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0333  ribulose bisophosphate carboxylase  38.35 
 
 		 492 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1478  ribulose bisophosphate carboxylase  39.85 
 
 		 488 aa  249  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.263508  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0686  ribulose bisophosphate carboxylase  38.11 
 
 		 489 aa  249  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.153221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4410  ribulose bisophosphate carboxylase  38.08 
 
 		 476 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1628  ribulose bisophosphate carboxylase  37.31 
 
 		 472 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1602  ribulose bisophosphate carboxylase  37.31 
 
 		 472 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1426  ribulose bisophosphate carboxylase  36.82 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6497  ribulose bisophosphate carboxylase  37.99 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0522154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0858  Ribulose-bisphosphate carboxylase  38.07 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1282  ribulose bisophosphate carboxylase  38.14 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2941  ribulose bisophosphate carboxylase  38.14 
 
 		 486 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4063  ribulose bisophosphate carboxylase  37.5 
 
 		 473 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3907  ribulose bisophosphate carboxylase  38.46 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1367  ribulose bisophosphate carboxylase  37.22 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1549  ribulose bisophosphate carboxylase  36.65 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2153  ribulose-bisphosphate carboxylase  37.59 
 
 		 476 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4332  ribulose bisophosphate carboxylase  37.27 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3422  ribulose bisophosphate carboxylase  38.06 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1987  ribulose bisophosphate carboxylase  37.27 
 
 		 473 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1046  ribulose bisophosphate carboxylase  36.2 
 
 		 473 aa  236  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00838845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0752  ribulose bisophosphate carboxylase  37.78 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.538188  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3203  ribulose bisophosphate carboxylase  37.16 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0752569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2641  ribulose bisophosphate carboxylase  36.01 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0119  ribulose bisophosphate carboxylase  37.16 
 
 		 473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2624  ribulose bisophosphate carboxylase  37.39 
 
 		 473 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0427  ribulose bisophosphate carboxylase  38.31 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3051  ribulose bisophosphate carboxylase  36.2 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2660  ribulose bisophosphate carboxylase  36.2 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08081  ribulose bisophosphate carboxylase  37.53 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05521  ribulose bisophosphate carboxylase  37.56 
 
 		 470 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1501  ribulose bisophosphate carboxylase  36.7 
 
 		 473 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0011462  normal  0.0288871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1614  ribulose bisophosphate carboxylase  37.08 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.036297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0922  ribulose bisophosphate carboxylase  36.93 
 
 		 473 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2322  ribulose bisphosphate carboxylase  35.03 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2743  ribulose bisophosphate carboxylase  36.43 
 
 		 473 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0550  ribulose bisophosphate carboxylase  37.33 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06061  ribulose bisophosphate carboxylase  37.33 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.142488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06141  ribulose bisophosphate carboxylase  37.33 
 
 		 471 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05761  ribulose bisophosphate carboxylase  37.33 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0310846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1879  ribulose bisophosphate carboxylase  37.3 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06041  ribulose bisophosphate carboxylase  37.3 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1691  ribulose bisophosphate carboxylase  37.39 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1389  ribulose bisophosphate carboxylase  37.39 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2836  ribulose bisophosphate carboxylase  35.97 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0838  ribulose bisophosphate carboxylase  36.8 
 
 		 471 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1846  ribulose-bisphosphate carboxylase  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0462  ribulose-bisphosphate carboxylase  31.58 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.105525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0252  ribulose-bisphosphate carboxylase  31.31 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243634  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0300  rubisco-like protein Rlp2  30.79 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.920574  normal  0.0975511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0263  RiBisCO-like protein  31.27 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.724133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1970  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.7 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2001  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  30.41 
 
 		 438 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000765161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1745  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  33.72 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0412  ribulose-bisphosphate carboxylase  31.39 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2334  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.27 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1640  ribulose-bisphosphate carboxylase large chain  32.13 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0850  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  30.94 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000268657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5642  ribulose-bisphosphate carboxylase  34.12 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.741434  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3067  ribulose-bisphosphate carboxylase  30.26 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1801  Ribulose-bisphosphate carboxylase  29.6 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2007  Ribulose-bisphosphate carboxylase  30.35 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.167441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0441  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  33.72 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1739  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.69 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000802921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2400  ribulose bisphosphate carboxylase  30.68 
 
 		 466 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3215  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  31.16 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7230  Ribulose-bisphosphate carboxylase  32.95 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4020  ribulose bisphosphate carboxylase  30.34 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4004  ribulose bisphosphate carboxylase  29.86 
 
 		 459 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.988794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>