More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0506 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0506  amino acid permease-associated region  100 
 
 
460 aa  892    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3413  amino acid permease-associated region  42.35 
 
 
513 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1733  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
462 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  29.41 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 
786 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 
764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  29.17 
 
 
770 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 
740 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.75 
 
 
753 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 
792 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
471 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 
486 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.4 
 
 
471 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.68 
 
 
471 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 
477 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 
500 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.64 
 
 
471 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
518 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
716 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
471 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 
820 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.59 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.24 
 
 
489 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  26.7 
 
 
471 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 
481 aa  96.7  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.8 
 
 
542 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.15 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 
549 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 
745 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 
773 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  29.16 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  26.21 
 
 
725 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  27.12 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  26.5 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.33 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
473 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.33 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.75 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  27.29 
 
 
476 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.29 
 
 
476 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  24.57 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 
467 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.6 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 
500 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.09 
 
 
426 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  25.63 
 
 
466 aa  90.1  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  23.17 
 
 
441 aa  90.1  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 
506 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.97 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  26.28 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
494 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 
466 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  28.49 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.05 
 
 
462 aa  89  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 
496 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.77 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  26 
 
 
502 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  26.46 
 
 
563 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 
466 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  28.49 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  27.63 
 
 
431 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 
538 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  28.49 
 
 
471 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.65 
 
 
467 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.65 
 
 
467 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
492 aa  86.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.19 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.19 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  25.9 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  26.01 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.65 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.19 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.19 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  26.25 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.19 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 
486 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.77 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.07 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  25 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  25 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>