21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4610 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4610    100 
 
 		 1169 bp  2317    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  89.83 
 
 		 1182 bp  69.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  89.83 
 
 		 1263 bp  69.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  85.92 
 
 		 1278 bp  61.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  89.09 
 
 		 1182 bp  61.9  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  92.68 
 
 		 1227 bp  58  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  94.29 
 
 		 1197 bp  54  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  88 
 
 		 1224 bp  52  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  87.04 
 
 		 1200 bp  52  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  90.24 
 
 		 1242 bp  50.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  88.89 
 
 		 1176 bp  50.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  90.24 
 
 		 1203 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  90.24 
 
 		 1242 bp  50.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  86.79 
 
 		 1131 bp  50.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 		 1194 bp  50.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  90.24 
 
 		 1176 bp  50.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  86.54 
 
 		 1167 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  86.54 
 
 		 1167 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  86.54 
 
 		 1167 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  86.54 
 
 		 1167 bp  48.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  91.67 
 
 		 1191 bp  48.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>