12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4399 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4399  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  675    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.760851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6629  hypothetical protein  58.7 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0469  hypothetical protein  49.04 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2174  hypothetical protein  43.71 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2083  hypothetical protein  43.09 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2707  hypothetical protein  41.81 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0571  hypothetical protein  35.5 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.55573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1586  hypothetical protein  35.29 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2540  hypothetical protein  33.89 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.292435  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1676  hypothetical protein  33 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2940  hypothetical protein  33 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3716  hypothetical protein  28.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0113791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>