24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4075 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4075    100 
 
 
141 bp  280  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1821  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3654  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.258841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3552  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3440  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0308754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3414  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3391  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3290  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3140  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3113  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2596  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2499  ISGsu3, transposase  84.75 
 
 
351 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2160  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1690  ISGsu2, transposase  84.75 
 
 
804 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1653  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891331  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1498  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1473  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282239  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1376  ISGsu2, transposase  84.75 
 
 
807 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1135  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.064838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1095  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0701  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0512  transposase, IS4  84.75 
 
 
1110 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0247  ISGsu3, transposase  84.75 
 
 
351 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.425976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0013  ISGsu3, transposase  84.75 
 
 
351 bp  46.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0180659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>