12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3283 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3283  cytochrome c, class I  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2650  cytochrome c, class I  87.19 
 
 		 225 aa  367  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1791  hypothetical protein  54.25 
 
 		 233 aa  231  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  32.11 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  23.64 
 
 		 743 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  25.91 
 
 		 969 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 		 345 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2793  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1194  hypothetical protein  38.98 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 326 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 133 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>