10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2628 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  594  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  53.18 
 
 		 274 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  40.37 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  43.48 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  35.39 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  47.33 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  61.02 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  55.81 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4496  hypothetical protein  46.81 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  40.43 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>