14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1342 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1342  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1109  hypothetical protein  83.95 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199159  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1675  hypothetical protein  67.35 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.026823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3796  hypothetical protein  67.59 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4434  hypothetical protein  64.02 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1495  hypothetical protein  64.08 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5522  hypothetical protein  65.44 
 
 		 161 aa  183  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4704  hypothetical protein  35.76 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00344811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3043  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3267  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3240  hypothetical protein  34.21 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4188  hypothetical protein  35.76 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5548  hypothetical protein  31.06 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1954  flagellar basal-body protein FlbY  24.26 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>