23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5448 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5448  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.289379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1649  hypothetical protein  90.14 
 
 		 71 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0606557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1872  hypothetical protein  88.24 
 
 		 75 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2771  hypothetical protein  90.77 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2583  hypothetical protein  89.23 
 
 		 70 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.011334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1042  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5016  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  45.9 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 212 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3086  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 69 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6709  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0579  hypothetical protein  40.38 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0276  excisionase family DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2699  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0931  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 68 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4424  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0301  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0819  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40.82 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4385  DNA binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 83 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>