63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4223 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4223  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7072  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  57 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4848  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  54 
 
 
102 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2143  PTS systemmannitol-specific transporter subunit IIC  60.22 
 
 
490 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5270  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  51 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1526  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  39.22 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.022737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0088  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  34.74 
 
 
628 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15272  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0985  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  33.67 
 
 
469 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.150194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  35.96 
 
 
650 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00834  PTS system, mannitol-specific II ABC component  35.96 
 
 
650 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0196  PTS system, mannitol-specific IIABC component  35.96 
 
 
649 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3932  PTS system, mannitol-specific IIABC component  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03454  fused mannitol-specific PTS enzymes: IIA components/IIB components/IIC components  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4016  PTS system, mannitol-specific IIABC component  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.659103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0113  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4969  PTS system, mannitol-specific IIABC component  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.873696  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03405  hypothetical protein  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4098  PTS system, mannitol-specific IIABC component  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3806  PTS system, mannitol-specific IIABC component  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0107  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  37.08 
 
 
637 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0268  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  38.89 
 
 
481 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3834  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  34.78 
 
 
478 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.826504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4070  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  37.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.293886  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3901  pts system mannitol-specific eiicba component  37.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3885  pts system mannitol-specific eiicba component  37.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.816196  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4008  PTS system mannitol-specific eiicba component  37.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.32191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3963  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  37.08 
 
 
638 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303673  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1252  mannitol-specific IIABC component, PTS system  32.97 
 
 
625 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000146575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0136  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  35.96 
 
 
636 aa  57.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4128  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  32.32 
 
 
643 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1845  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.67 
 
 
467 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3164  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  32.99 
 
 
668 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0026  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  32.32 
 
 
643 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3780  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIABC  32.32 
 
 
643 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0072  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  33.71 
 
 
639 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337525  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2226  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  32.61 
 
 
512 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2188  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  32.61 
 
 
512 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4165  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  35.63 
 
 
635 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4447  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  35.63 
 
 
635 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2813  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  36.05 
 
 
650 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5589  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  34.04 
 
 
658 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3253  pts system mannitol-specific eiicba component  31.76 
 
 
459 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3320  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  31.76 
 
 
459 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001413  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIBC subunit  34.38 
 
 
420 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259327  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0028  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  30.69 
 
 
517 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  34.04 
 
 
657 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3267  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0761  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02763  predicted fused mannitol-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3365  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02726  hypothetical protein  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4234  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0778  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  33.72 
 
 
462 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3090  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component, truncation  33.72 
 
 
407 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  36.36 
 
 
635 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1219  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  32.26 
 
 
660 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07060  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  33.33 
 
 
687 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0220  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  36.14 
 
 
486 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4768  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  28.12 
 
 
508 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3789  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  30.85 
 
 
676 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0054  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  30.59 
 
 
512 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0659  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  40.32 
 
 
436 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0458  PTS system, mannitol-specific IIBC component  31.65 
 
 
525 aa  44.3  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.646775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>