More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3736 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 206 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  58.38 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  61.19 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.83 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  55.28 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  54.04 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  54.55 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  54.59 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  54.08 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.66 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  46.86 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.42 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.92 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  36.36 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  36.14 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  31.61 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  31.61 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  31.09 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  31.09 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.24 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 204 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  30.99 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.21 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  31.4 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  32.92 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.26 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  37.07 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  32.92 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  32.92 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  32.92 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  37.33 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  30.99 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  37.72 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  39.57 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  34.9 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  35.26 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  35.33 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.96 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.87 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.19 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0589  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.95 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.97 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.15 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  33.56 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.55 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3717  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4194  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.93 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4307  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  34.71 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  34.34 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.32 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>