16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3049 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3049  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2046  hypothetical protein  55.13 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2124  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.2 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00535032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6258  hypothetical protein  38.57 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0456177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3670  hypothetical protein  35.19 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0940842  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.96 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.46 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.46 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.85 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  30.74 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.05 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.53 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.83 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.79 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.63 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>