27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2546 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.520917 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1420  hypothetical protein  60 
 
 
184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2412  acetyltransferase  21.34 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  24.16 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  21.89 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 
213 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0592  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02392  hypothetical protein  22.54 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1452  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
172 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  25.56 
 
 
373 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
181 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  21.13 
 
 
158 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0266  acetyltransferase-like  25.77 
 
 
223 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.879023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
270 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
164 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
168 aa  41.6  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  29.29 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
160 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>